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4351.基于S7核糖体蛋白基因部分序列的7种金线鱼属鱼类分子系统进化关系
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
测定了7种金线鱼属(Nemipterus)及2种锥齿鲷属(Pentapus)鱼类S7核糖体蛋白基因(S7基因)内含子1部分序列,以二线眶棘鲈(Scolopsis bilineatus)做为外类群初步探讨了其分子进化关系.测序所得S7部分序列为734~746 bp,序列比对后得到同源序列743 bp.其中保守位点386个,变异位点351个,简约性信息位点289个.A+T含量(54.1%)高于G+C含量(45.9%).基于Kimura 2-Parameter模型计算出7种金线鱼的遗传距离为0.042~0.294.S7序列存在大量碱基插入与缺失,其中日本金线鱼(Nemipterus japonicus)与苏门答腊金线鱼(N. mesoprion)在第167、182、474、608、662 bp位置,金线鱼(N. virgatus)与印度洋金线鱼(N. bipunctatus)第227、332、401、604 bp的位置具有相同的碱基插入缺失特征,且具有种类特异性.最后利用最大似然法(ML)与贝叶斯分析(BI)构建分子系统进化树,7种金线鱼聚在一起,其中日本金线鱼与苏门答腊金线鱼聚为一支,金线鱼、深水金线鱼和印度洋金线鱼聚成一支.结论认为需要结合多方面的形态与分子证据,才能进一步明确金线鱼属鱼类的系统进化关系.
关键词：金线鱼属;系统发育;S7核糖体蛋白基因;Nemipterus;phylogeny;S7 ribosomal protein gene
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4352.重组激活基因（RAGs）功能机制及其在鱼类早期发育中的作用
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
在B淋巴细胞和T淋巴细胞的发育过程中， BCR和TCR基因座(Igκ、Igλ、Igh、Tcrα、Tcrβ、Tcrγ、Tcrδ)的可变区(V)、多样区(D)、链接区(J)发生 V(D)J 重排，该重排过程是在重组激活蛋白(RAG-1和 RAG-2)的作用下完成的， V(D)J 重排机制使机体拥有庞大的抗体库，以应对自然界中多元的病原微生物。RAGs 结构分为核心区和非核心区，核心区域发挥着重要的基因片段酶切功能，而非核心区域的九聚体序列(nonamer)、锌指等结构具有调节V(D)J重排的功能。RAGs的功能在转录水平、染色体水平以及蛋白水平受到严格的时间和空间调控，以保证B/T细胞的正常发育。随着国内外学者对哺乳动物RAGs基因的结构与功能机制的深入研究， RAGs也在淡水鱼和海水鱼中有了越来越多的报道。由于 RAGs 的功能特点以及在进化过程中的稳定性，其已成为研究鱼类免疫系统发育过程和系统进化的重要分子标记。本文在赤点石斑鱼(Epinephelus akaara) RAGs研究的基础上探讨了RAGs定位鱼类免疫系统的发生过程，旨在为鱼类人工繁殖技术的突破、鱼类疫苗的开发与研制以及鱼类免疫学研究等提供理论借鉴。
关键词：重组激活酶;免疫球蛋白;T细胞受体;早期发育;鱼类特异免疫;recombination activating genes;immunoglobulin;T cell receptor;development;fish adaptive immunity
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4353.干旱胁迫下外源ABA对观赏海棠叶片可溶性蛋白和脱水素积累的影响
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
以抗旱性较强的观赏海棠品种‘王族’和抗旱性较弱的品种‘红丽’幼树为试材,采用“喷施ABA+干旱处理”和“喷水+干旱处理(对照)”2个处理组,测试不同干旱条件下ABA处理的观赏海棠叶片相对含水量(RWC)、相对电导率(REC)、可溶性蛋白含量(SPC)、可溶性蛋白和脱水素表达情况.结果显示:与对照相比,ABA处理的‘王族’叶片RWC显著升高,REC和SPC显著降低,而‘红丽’的相应指标变化则相反.SDS-PAGE分析表明:ABA处理分别引起了干旱处理过程中‘王族’叶片14.8,18.0,46.2,50.9,78.1,145.2 ku和‘红丽’叶片14.4,18.0,32.8,46.2,89.6,141.0 ku可溶性蛋白的变化.免疫蛋白印迹法测定结果表明:干旱处理分别诱导‘王族’叶片14.8,51.0 ku和‘红丽’叶片14 4,32.8 ku脱水素的积累；ABA处理显著地的诱导2品种叶片干旱处理开始时脱水素的积累,并降低干旱处理7天后‘王族’叶片14.8,51.0 ku和‘红丽’叶片14.4 ku的积累.ABA能够诱导正常水分条件下观赏海棠叶片脱水素的表达,但当植株处于干旱胁迫时,ABA抑制其叶片中被诱导的脱水素的积累,并且此抑制作用与品种间抗旱性呈正相关性.
关键词：观赏海棠；ABA；干旱胁迫；可溶性蛋白；脱水素
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4354.Na+-K+-ATPaseα1基因全长cDNA的克隆及序列分析和表达
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
为了解Na+-K+-ATPase a1基因的分子结构及其在建鲤盐度调控过程中起到的作用,采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法分离克隆了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)Na+-K+-ATPase α1基因全长cDNA,得到3 397 bp的全长cDNA,包括3 081 bp的开放阅读框(ORF),232 bp的5’末端非编码区(UTR)以及219 bp的3’末端非编码区(UTR).对推测的该基因氨基酸序列进行同源性比对和系统分析显示:建鲤与其他鱼类该基因的氨基酸序列相似度为90.22％～95.52％,与斑马鱼(Danio rerio)相似度最高(95.52％),与虱日鱼(Chanos chanos)相似度偏低,其次是平鲷(Rhabdosargus sarba)、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)、底鳉(Fundulus heteroclitus)、黑鲷(Acanthopagrusschlegelii)、马苏大马哈鱼(Oncorhynchus masou)和虹鳟(Oncorhynchus mykiss),与大两洋鲑(Salmo salar)的相似度最低(90.22％),与非洲爪蟾(Xenopus laevis)和人(Homo sapiens)的相似度分别为89.62％和89.51％.以上结果表明,不同物种间的Na+-K+-ATPase α1基因的氧基酸序列极为保守.用实时定量PCR (RT-PCR)检测该基因在建鲤鳃,肾、肠、肝、脑和脾的相对表达量,其中脑最高,其次是鳃、脾、肾、肠,肝最低,这表明脑、鳃和脾是建鲤Na+-K+-ATPaseα1基因主要的表达器官.本研究旨为进一步探索建鲤的盐度调控机制奠定分子基础.
关键词：建鲤；Na+-K+-ATPaseα1；克隆；序列分析；组织表达
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4355.胶州湾中部海域虾类群落结构及其多样性
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
根据2008年9月至2009年8月在胶州湾中部海域进行的逐月底拖网调查数据,应用相对重要性指数、生物多样性指数和多元统计分析等方法对虾类群落结构及多样性进行了研究.结果表明:该调查海域捕获虾类共17种,隶属于6科15属.虾类相对资源量具有明显的月间变化,9月、10月、6月资源量较高,平均网获质量的变化范围为223.9~3422.9 g/h,平均网获尾数为41~1608 ind/h;优势种组成具有较为明显的月间变化,全年的优势种为鹰爪虾(Trachysalambra curvirostris)、细巧仿对虾(Parapenaeopsis tenella)和日本鼓虾(Alpheus japonicus).虾类种类丰富度指数(D)的变化范围为0.77~1.89, Shannon-wiener 多样性指数(H′)变化范围为0.90~2.34,均匀度指数(J)变化范围为0.26~0.76,多样性指数月变化较大,且春夏季高于秋冬季.CLUSTER 聚类分析与 MDS 分析可将胶州湾中部海域全年虾类群落划分为4个月份组群:Ⅰ组群(4月、5月),Ⅱ组群(12月—翌年3月),Ⅲ组群(6月、9月、10月)和Ⅳ组群(7月、8月、11月).ANOSIM 分析表明,Ⅱ组群与Ⅲ组群、Ⅱ组群与Ⅳ组群差异显著,其他组群间差异不显著.各组群典型种与组群间分歧种对群落结构的影响明显.BIOENV 分析表明,底层水温是影响胶州湾中部海域虾类群落结构月变化的主要环境因子.本研究旨在为保护与合理利用胶州湾海域虾类资源对策的制定提供科学依据.
关键词：胶州湾;虾类;群落结构;种类多样性;Jiaozhou Bay;shrimp;community structure;species diversity
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4356.加拿大哥伦比亚省美国黄松广义代数差分型地位指数模型
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
基于3种常用的理论生长模型,利用代数差分法和广义代数差分法推导8个差分型地位指数模型.模型拟合采用加拿大哥伦比亚省美国黄松林分79个临时样地的纵向剖面解析木数据和分类变量回归的参数估计方法,模型筛选采用统计指标和图形分析相结合的方法,并着重突出了图形分析的重要性；同时,本文对于最佳模型的应用也进行了较为全面的分析研究.结果表明:1)广义差分型地位指数模型具有更高的预测性能；2)基于Hossfeld IV生长模型的广义差分型地位指数模型表现出了最佳的性能,推荐采用该模型对加拿大哥伦比亚省30～200年的美国黄松林分进行树高生长预测和立地质量分类；3)依据预测的相对误差,确定100年为最佳指数年龄.
关键词：地位指数模型；广义代数差分法；美国黄松；指数年龄
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4357.长牡蛎糖原磷酸化酶基因SNPs与生长性状和糖原含量的相关性分析
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
为研究糖原磷酸化酶基因多态性与长牡蛎(Crassostrea gigas)生长和糖原含量的相关性,本研究对长牡蛎糖原磷酸化酶基因(Cg-GPH)编码区单核苷酸多态性(SNPs)与来自5个家系322个长牡蛎个体的生长性状(包括壳高、壳长、壳宽、总体质量以及软体部质量)和糖原含量进行了关联分析.结果表明,在1940 bp的长牡蛎糖原磷酸化酶基因中共检测到82个SNPs位点,其中63个SNPs位点位于外显子区域,1个SNPs位点位于5′-UTR区,18个SNPs位点位于3′-UTR区,编码区SNPs平均密度为1/25 bp;5个SNPs位点与生长性状存在显著相关(P
关键词：长牡蛎;糖原磷酸化酶基因;生长性状;糖原;SNPs;Crassostrea gigas;glycogen phosphorylase gene;growth performance;glycogen;SNPs
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4358.平面振动筛分装置气流场的数值模拟与试验
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
为了探索平面振动筛分装置清选室内气流场的分布规律,运用CFD软件Fluent对其气流场进行了数值模拟.模拟结果表明:气流从风机到筛面,形成比较顺畅的流场,在筛面出口后由于鱼鳞筛的作用,气流方向朝清选室出口处变化,有利于将杂物吹出.为验证数值模拟的可行性,在清选实验台上对筛面中点及出风口的风速进行了测量.测试结果与数值模拟结果对比分析表明:CFD数值模拟结果与实际风速变化规律一致,但CFD模拟值比实际值稍高.
关键词：数值模拟;试验;平面振动筛;CFD;numerical simulation;test;plane vibrating sieve;CFD
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4359.噻嗪酮-烯啶虫胺在水稻田样品中的残留检测方法
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
建立了噻嗪酮-烯啶虫胺在水稻植株、稻米、稻壳、稻田水和土壤中的残留分析方法.稻田水采用硅胶柱分离、净化和富集,高效液相色谱定量检测噻嗪酮和烯啶虫胺.稻田土、稻米和稻谷壳均采用氯仿/丙酮(体积比为2:1)超声提取,稻米和稻谷壳样品提取后浓缩,定容后直接定量分析,而土壤样品经硅胶柱净化后定量分析.以石油醚/丙酮(体积比为95∶5)和氯仿/丙酮(体积比为3∶1,)为提取剂,分别提取水稻植株中噻嗪酮-烯啶虫胺的残留量,硅胶柱净化.稻田土、水稻植株、稻米和稻谷壳样品中噻嗪酮和烯啶虫胺残留量提取净化后均采用气相色谱电子捕获检测器检测.稻田水直接上样于硅胶柱吸附,用石油醚和甲醇洗脱并分别收集、浓缩后定容,高效液相色谱紫外检测器定量检测.结果表明:高效液相色谱法检测噻嗪酮和烯啶虫胺的线性范围为0.01 ～ 10.00 mg·L-1时,相关系数(R2)分别为0.999 8和0.999 7.气相色谱法检测噻嗪酮-烯啶虫胺的线性范围为0.005 ～4.00 mg·L-1,R2分别为0.999 1和0.994 7.在试验添加浓度范围内,噻嗪酮和烯啶虫胺在水稻田所有样品中的添加回收率分别为77.10％～112.23％和80.04％～115.94％,相对标准偏差(RSD)分别为0.29％～ 10.57％和0.70％ ～8.86％.
关键词：噻嗪酮;烯啶虫胺;水稻;前处理;气相色谱法;高效液相色谱法;buprofezin;nitenpyram;rice;preparation;gas chromatography (GC);high performance liquid chromatography (HPLC)
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4360.仿刺参性别相关基因P450c17的克隆与序列分析
[农、林、牧、渔业] [2014-05-15]
本研究克隆了仿刺参(Apostichopus japonicus)P450c17基因的全长cDNA,结果表明其cDNA的5′端UTR为256 bp,3′端UTR为250 bp,ORF为l 530 bp.在3′端有特殊序列ATTTA、终止密码子TAA和polyA加尾.其全长cDNA编码509个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子量57.6 kD,理论等电点5.5.P450c17的氨基酸序列存在长度为25个氨基酸的信号肽,1个长度为22个氨基酸的跨膜区,1个糖基结合位点NHS,1个P450特有的结构域,其氨基酸序列具有明显的细胞色素P450基因家族的特征.结构域中亚铁血红素结合域中的精氨酸R和发挥活性所必须的半胱氨酸C都是保守的.这些结构组成了血红素结合环、质子传递槽和K螺旋及绝对保守EXXR基序.蛋白前体二级结构中无规则卷曲占41.22％,延伸链占12.77％,α-螺旋占46.01％,不含B-折叠.氨基酸序列与其他物种氨基酸序列的同源性在35％～41％之间.系统进化树表明仿刺参与长牡蛎(Crassostrea gigas)及文昌鱼(Branchiostoma belcheri)聚为一支,黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、鲇(Clarias gariepinus)、日本鳗鲡(Anguilla japonica)及白斑角鲨(Squalus acanthias)聚为一支,三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)、金眼门齿鲷(Stenotomus chrysops)、斑马鱼(Danio rerio)、鲤(Cyprinus carpio)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、牙鲆及青鳉(Fundulus heteroclitus) 聚为一支.研究结果为进一步探讨仿刺参P450c17在性激素调控性别分化方面的功能提供参考.
关键词：仿刺参；P450cl7；基因克隆；序列分析
027-87841330