关键词：PepOSX;多肽组学;多肽;结构鉴定;活性肽
摘 要：开展多肽组学分析是解析加工过程中多肽变化规律的关键。本文主要就PepOSX软件在已知肽混标和食源性蛋白酶解产物中的多肽组学鉴定应用效果进行评价，并探讨了不同鉴定方式、工作参数对单多肽检出率和鉴定结果准确率的影响。结果表明：Exhaust引擎在不依赖序列库的条件下，对胶原肽和酪蛋白肽混标的鉴定结果准确率分别为67.86%和36.36%，对应准确检出率达80%和100%，反映该引擎对发现未知短肽具有较好的适应性；Search引擎基于序列搜库，对前述混标的鉴定结果准确率分别高达71.43%和90.48%，检出率分别高达91.30%和100%，展现对已知蛋白源样品分析的优越性能。将上述引擎联动用于酶解产物的组学分析，并将其与SEQUEST、Myri Match和X! Tandem进行对比，发现PepOSX的准确检出率远优于其他三者，且在酪蛋白、大豆蛋白酶解产物的鉴定中获得了约3～4倍于后者的鉴定数量，充分展示了PepOSX在非特异性多肽鉴定中的适用性与可靠性。未来，PepOSX将有望为探索新活性肽或揭示多肽变化机制提供有效的技术支持。
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