上海市浦东新区市售食品中创伤弧菌病原学遗传特征
作者:梁艳茹; 吕彬; 胡旖桓; 丁锦; 桂燕华; 邱慧芳; 丰俊; 赵冰; 王筱
加工时间:2025-01-16
信息来源:中国热带医学
关键词:创伤弧菌;耐药;毒力基因;耐药基因;系统进化分析;市售食品
摘 要:目的 了解上海市浦东新区市售食品中创伤弧菌污染情况、耐药、毒力、基因分型特征与遗传进化关系。方法 采用微量肉汤法进行药物敏感性实验,使用illumina测序平台进行全基因组测序,基于VFDB、CARD、PubMLST等数据库预测毒力、耐药基因及多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST),基于全基因组单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)构建系统发育树进化分析。结果 2023年市售食品中创伤弧菌检出率为4.56%(51/1119),优势检出类别依次为贝类(20.16%,25/124),鱼类(6.74%,19/282)、虾类(6.56%,4/61)、即食水产类(9.09%,2/22)及畜肉类(0.33%,1/300)。创伤弧菌对头孢唑啉耐药率最高为23.5%(12/51),其次是氨苄西林、四环素和复方新诺明。携带四环素类(tetA、tetC)、喹诺酮类(QnrVC6、QnrVC4)、碳青霉烯类(varG)等29种耐药基因,鞭毛(fla E)、铁离子吸收(hutA)等相关毒力基因163种。MLST结果共发现41种ST型别(一株未分型),其中新产生ST型别32种,有38株分离株为新ST型,优势ST型别为ST326(5.88%,3/51)和ST667(5.88%,3/51)。SNP结果显示所有菌株分为3大分支,系统发育树内部分支较长,具有较高的同源重组性。结论 浦东地区市售食品中,贝类和鱼类中创伤弧菌污染严重。分离的菌株耐药谱广泛,存在多重耐药现象,且携带多种毒力及耐药相关基因。菌株基因组高度同源重组,具有一定的食品安全隐患风险,建议加强对其监测管理。
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