烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及分析
关键词:萜类化合物;牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶;克隆;生物信息学分析
摘 要:采用RACE技术,从烟叶中克隆了一个新的编码GGPPS蛋白的基因,命名为Ntggpps3,并对其进行了生物信息学分析.Ntggpps3的cDNA序列为1251 bp,包含一个长度为1092 bp的开放阅读框,编码363个氨基酸.NtGGPPS3蛋白与其他植物GGPPSs高度保守.生物信息学预测结果表明,NtGGPPS3的分子量为39.5 kD,等电点为6c28,为亲水性蛋白,N端有叶绿体信号肽.二级结构主要由螺旋和无规则卷曲组成,三级结构含有两个富含天冬氨酸的区域,并通过同源建模构建了NtGGPPS3的3D模型.进化分析表明,植物的GGPPS分为大亚基和小亚基两个分支,而且NtGGPPS3属于大亚基.