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烟草牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及分析
作者:李明;李锋;金立锋;罗朝鹏;杨军;林福呈 作者单位:中国科学院植物研究所,北京市海淀区香山南辛村20号 100093;中国烟草总公司郑州烟草研究院,郑州高新技术产业开发区枫杨街2号450001 加工时间:2013-11-15 信息来源:《烟草科技》
关键词:萜类化合物;牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶;克隆;生物信息学分析
摘 要:采用RACE技术,从烟叶中克隆了一个新的编码GGPPS蛋白的基因,命名为Ntggpps3,并对其进行了生物信息学分析.Ntggpps3的cDNA序列为1251 bp,包含一个长度为1092 bp的开放阅读框,编码363个氨基酸.NtGGPPS3蛋白与其他植物GGPPSs高度保守.生物信息学预测结果表明,NtGGPPS3的分子量为39.5 kD,等电点为6c28,为亲水性蛋白,N端有叶绿体信号肽.二级结构主要由螺旋和无规则卷曲组成,三级结构含有两个富含天冬氨酸的区域,并通过同源建模构建了NtGGPPS3的3D模型.进化分析表明,植物的GGPPS分为大亚基和小亚基两个分支,而且NtGGPPS3属于大亚基.
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