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甲型流感病毒HA蛋白质序列的预测
作者单位:江南大学理学院,江苏无锡,214122 加工时间:2014-04-15 信息来源:食品与生物技术学报
关键词:甲流;HA蛋白质序列;预测;CGR游走模型;ARFIMA(p,d,q);influenza virus;HA protein sequence;prediction;CGR walk model;ARFIMA (p,d,q)
摘 要:基于CGR-游走模型和分数阶差分,用ARFIMA模型预测甲型流感病毒HA蛋白质序列.对所选取1943~2013年同源性相对较高的71条蛋白质序列,用ARFIMA(p,d,q)模型对前20个位置去拟合并且预测,除极个别外由预报区域图显示原始数据都在预报区域内,表明模型建立的比较合理,预报效果很好.这对流感病毒的研究和预测有着重要的意义.
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