目的：剖析我国新财务制度实践过程中存在的问题并提出改进对策。方法：开展问卷调查以及访谈，利用Spss13.0对收集的数据进行统计分析。结果：①预算管理方面，41.3%的调查对象所在医院没有设立预算管理机构，预算执行情况的考核仅占29.6%；②成本核算方面，73.3%者认为成本归集和分摊存在困难；③内部控制方面，18.8%者认为医院的内部控制体系不健全、42.5%者所在医院未设立资金管理机构；④资产管理方面，19.0%者提到医疗风险基金提取不足。结论：公立医院在实践新财务制度中仍存在预算执行缺乏考核和监督机制，成本核算的归集和分摊存在困难，内部控制体系不健全，坏账准备与医疗风险基金计提不足等问题。针对存在的问题提出多项解决对策，以进一步发挥财务制度对医院经济管理工作的指导作用。