基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析
关键词:祁门种群体;EST-SSR;遗传多样性;亲缘关系
摘 要:利用24 对EST-SSR 引物对祁门种群体66 个单株和安徽1 号进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:祁门种群体具有相对较高的遗传多样性,24 对引物共检测到等位位点69 个,平均2.88 个;引物多态性含量PIC 为0.18~0.85,平均值为0.47;杂合度观测值(Ho)在0.09~0.96 之间,平均值为0.41;杂合度期望值(He)在0.23~0.76 之间,平均值为0.50;群体内的Shannon 指数I 为0.39~1.50,平均0.89。根据相似系数矩阵按UPGMA 法进行聚类,在相似系数平均值0.50 处可将参试的67 份材料划分为六大类,其中第Ⅰ类含有44 个祁门种群体单株及安徽1 号,占总数的67.16%,是祁门种的核心类群。