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拟南芥转酮醇酶蛋白AtTKL1的同源建模及与α-三联噻吩结合作用分析
作者:赵斌;霍静倩;邢继红;齐萌;张金林;董金皋 作者单位:河北农业大学植物保护学院;河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室 加工时间:2015-05-03 信息来源:高等学校化学学报 索取原文[5 页]
关键词:转酮醇酶;α-三联噻吩;同源建模;分子对接
摘 要:以玉米转酮醇酶(1ITZ)的晶体结构为模板,对拟南芥转酮醇酶(At TKL1)的三维结构进行模拟和优化。利用生物信息学方法,确定其氨基酸结合位点为His143,Gly234,Asn263,Arg434,Ser461,Gln488,Phe515,His539,Asp547和Arg598,催化氨基酸位点为His103和His340.通过分子模拟确定α-三联噻吩与At TKL1的活性口袋可有效结合,且At TKL1的催化位点和结合位点为其与α-三联噻吩结合的键位点。利用荧光猝灭光谱技术确定At TKL1与α-三联噻吩之间存在结合作用;酶活力检测结果表明加入α-三联噻吩后转酮醇酶蛋白的活性降低,进一步验证了At TKL1与α-三联噻吩之间的相互作用。
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