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坛紫菜“申福2号”的SSR分子标记
作者单位:张庆杰,李琳,ZHANG Qingjie,LI Lin(上海海洋大学 水产与生命学院,上海,201306)严兴洪,YAN Xinghong(上海海洋大学 水产与生命学院,上海 201306; 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海 201306) 加工时间:2014-05-15 信息来源:中国水产科学
关键词:坛紫菜;“申福2号”;微卫星DNA标记;品系鉴定;Porphyra haitanensis;SF-2;SSR marker;strain identification
摘 要:  利用微卫星(SSR)分子标记技术,对坛紫菜(Porphyra haitanensis)优良品系“申福2号”的丝状体和叶状体分别进行了特异性分子标记鉴定,结果发现:用9#引物(序列为 F: TCACAATGGGTGATATGGC; R: CCACAT TTAAGTCCGACTCTG)对“申福2号”丝状体的DNA进行扩增,出现了能区别于其他14个品系(6个优良品系,3个杂交品系,5个野生品系)的特异性条带。用该引物对室内培养的“申福2号”叶状体的DNA进行扩增,也均获得了与丝状体相同的特异性条带。此外,用该引物分别对栽培在不同海区和不同时期采收的“申福2号”叶状体进行验证,结果均出现了与丝状体相同的特异性条带。该特异性条带的DNA测序结果证实,9#引物产生的SSR标记反映了微卫星DNA重复序列的变化。通过 SSR Hunter软件搜索到了设计引物时的核心序列,所得产物大小在预期长度范围内,是特异性扩增。通过 BLAST 比对得知,该序列在核酸数据库中没有同源序列,是一个新序列。通过DNAMAN软件分析得知,“申福2号”、“申福1号”之间序列差异较小,与坛紫菜霞浦野生种差异较大。这证实该标记反映的是种内品系间的差异,可以用于种内品系鉴定。上述结果表明,由9#引物扩增出的这一特异性条带可以认为是“申福2号”丝状体和叶状体的特异性标记,可用于该品系的种质鉴定。
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