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桑沟湾不同养殖区水体微生物群落结构特征
作者单位:中国水产科学研究院 黄海水产研究所,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东省渔业资源与生态环境重点实验室,山东 青岛266071 加工时间:2014-05-15 信息来源:中国水产科学
关键词:微生物群落结构;DGGE;桑沟湾;养殖区;bacterial community structure;DGGE;Sanggou Bay;mariculture
摘 要:  采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术研究了2007年夏季桑沟湾不同养殖区水体微生物群落结构特征。DGGE指纹图谱分析表明,不同站位之间既存在共同图谱,又具有各自的特征谱带,总体上可分为4个区,湾外区、湾口区,湾中区和湾底区,分别与非养殖区、海带养殖区、综合养殖区、贝类单养与网箱养殖区行相对应;扇贝养殖区和牡蛎养殖区微生物相似性最高为94%,贝类单养与网箱养殖区和非养殖区相似性最低为41%,仅在网箱区发现对含氮污染物有去除作用的玫瑰杆菌属(Roseobacter)。17个站位表层水样共获得30个优势菌群,选择比较明显的12条带进行回收、扩增和测序,与GenBank中已经登录的细菌种群的同源性进行比较(相似性92%~98%),结果表明,这12条序列所代表的细菌分属于变形菌亚门(α-proteobacteria和γ-proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)。研究结果说明贝类单养和网箱养殖对环境的改变较大,海带养殖对环境的改变较小,综合养殖能减少贝类和网箱养殖对环境的污染程度,是一种值得大力推广的养殖模式。
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