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基于模糊邻近关系的p53抑癌基因家族聚类分析
作者单位:江南大学 理学院,江苏无锡,214122 加工时间:2014-04-15 信息来源:食品与生物技术学报
关键词:p53;p63;p73;模糊邻近关系;模糊等价矩阵;聚类分析;p53;p63;p73;fuzzy proximity relation;fuzzy equivalence matrix;clustering analysis
摘 要:模糊聚类技术在揭示数据的联系及数据间的依赖关系等方面占有重要作用.作者根据模糊等价关系的性质,利用加权汉明距离法,建立了序列间的模糊邻近关系,进而构造模糊等价矩阵进行聚类分析.选取了18条人类p53及其家族成员p63、p73肿瘤蛋白mRNA序列,以序列碱基的比例为指标,进行聚类分析.发现,当λ=0.951 59时,结果分为3类,p53、p63、p73各自成为一类.从聚类角度看p53、p63、p73的结构和功能是有区别的.此方法对预测未知基因的结构和功能有一定的生物意义.
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