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草鱼C1qC基因的克隆及表达分析
作者单位:上海海洋大学 水产动物种质资源挖掘与利用教育部重点实验室, 上海201306 加工时间:2014-05-15 信息来源:中国水产科学
关键词:草鱼;C1qC基因;克隆;表达;草鱼呼肠孤病毒;Ctenopharyngodon idella;C1qC gene;expression;grass carp reovirus
摘 要:为了研究C1qC基因在草鱼(Ctenopharyngodon idella)免疫过程中所起的作用,利用RT-PCR和RACE方法克隆获得了 C1qC 基因 cDNA 全长序列,经序列分析表明,所克隆的 C1qC cDNA 全长为916 bp,包括开放阅读框(open reading frame, ORF)735 bp,5′端非编码区(untranslated region, UTR)89 bp和3′端非编码区(UTR)92 bp.735 bp的ORF共编码244个氨基酸,相对分子量为26162.5 U.同源性分析表明,草鱼与斑马鱼(Danio rerio)的相似度最高,达到71%.经草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus, GCRV)诱导后,草鱼C1qC基因在鳃、皮肤、肌肉、肝、中肾、心脏、头肾等组织中的mRNA表达水平均显著上调.在草鱼胚胎发育的各个阶段都能检测到C1qC mRNA的表达,说明该基因可能在草鱼胚胎和鱼苗的免疫反应和早期发育中起重要作用.本研究将为今后在草鱼免疫功能方面深入研究C1qC基因提供基础资料.
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