关键词：分子动力学;抗菌谱;β-折叠;尼龙扣;Pg-AMP1;多肽分子;组氨酸标签;分子模拟;溶剂化;
摘 要：植物来源的富含甘氨酸蛋白(GRPs)家族的蛋白质和多肽分子中均含有重复的甘氨酸区域,并具有不同功能。推测GRPs结构有两种构象:形成尼龙扣形式的甘氨酸环和几条β-链组成的反平行β-折叠。Pg-AMP1是目前发现的唯一一个有抗菌活性的植物GRP,但其结构尚不清楚。近期有报道重组表达该蛋白,该重组肽在N-末端有额外的蛋氨酸残基,在C-末端有组氨酸标签(His6-tag),这些变化使重组肽的抗菌谱更广。本研究通过从头分子模拟和分子动力学研究,观察到天然和重组肽结构都是由N-末端的ɑ-螺旋和相当于2/3蛋白的动态环组成。
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