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烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析
作者:雷波;丁福章;胡重怡;潘文杰;卢坤;刘小容 作者单位:贵州省烟草科学研究所,贵阳市金阳区云潭北路 550081;西南大学农学与生物科技学院,重庆市北碚区天生路2号 400715 加工时间:2013-11-15 信息来源:《烟草科技》
关键词:烟草;橙蛋白基因;克隆;生物信息学
摘 要:为了获得烟草OR(NtOR)基因的全长序列和进一步揭示其在特色烟叶形成中的作用,采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了NtOR的全长cDNA和基因组DNA序列,GenBank登录号为JN379458和JN375578.生物信息学分析表明,NtOR基因组DNA全长5027bp,cDNA为1188 bp,编码317个氨基酸残基.NtOR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点,二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠,亚细胞定位于质膜上.系统进化与BLAST分析表明,NtOR是SlOR和ViOR的垂直同源基因.GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示,NtOR基因在子叶中的表达量最高,其次是成熟叶片、幼茎和花,其他组织器官的表达相对较弱.
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