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烟草类胡萝卜素双加氧裂解酶基因的克隆与序列分析
作者:夏庆友;高军平;王根洪;程廷才;段军 作者单位:西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室 400715;重庆大学农学及生命科学研究院 400044;重庆大学农学及生命科学研究院 400044;西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室 400715 加工时间:2013-11-15 信息来源:《烟草科技》
关键词:烟草;CCD4基因;RT-PCR;序列分析
摘 要:为揭示类胡萝卜素双加氧裂解酶基因(CCDs)在烟草生长发育过程中的功能,通过RT-PCR技术克隆到烟草的类胡萝卜素双加氧裂解酶4基因(NtCCD4),编码区1806 bp,编码601个氨基酸,基因序列提交NCBI,GenBank登录号为JF947192.根据氨基酸组成对NtCCD4基因编码蛋白的疏水性/亲水性、蛋白结构及进化关系等进行预测和分析.结果表明:烟草NtCCD4基因编码的蛋白分子量为65936.3 Da,等电点为6.58,定位在叶绿体膜上,为一个稳定的亲水性蛋白;二级结构预测显示此蛋白结构以无规则卷曲(57.4%)为主,α螺旋(13.31%)和β转角(6.61%)所占比例相对较少;进化分析表明NtCCD4是类胡萝卜素双加氧裂解酶基因( CCDs)家族中的一个成员,与其他物种的CCD4蛋白比较显示NtCCD4编码的蛋白含有多个保守区域,其中4个组氨酸残基是组成蛋白功能域所必须的,它们与Fe2+结合共同组成蛋白酶的活性中心.
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