干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片SSH文库构建及CkWRKY1基因克隆
作者单位:杨杞,张涛,王颖,尹佳佳,韩晓敏,李国婧,王瑞刚(内蒙古农业大学生命科学学院 呼和浩特010018)李高(内蒙古农业大学生命科学学院 呼和浩特010018;北京市颐和园管理处 北京100091)齐力旺(中国林业科学研究院林业研究所 北京100091)
加工时间:2013-10-15
信息来源:林业科学
关键词:柠条锦鸡儿;干旱胁迫;抑制性差减杂交(SSH)文库;WRKY;基因克隆;Caragana korshinskii;drought stress;suppression subtractive hybridization (SSH) library;WRKY;gene cloning
摘 要:为研究柠条锦鸡儿抗旱的分子机制,挖掘干旱响应相关基因,成功构建干旱胁迫下柠条锦鸡儿叶片的抑制性差减杂交(SSH)文库,获得1 286条高质量的EST序列,平均长度475 bp,拼接得到Unigenes 645条.对这些Unigenes进行Blast比对注释后发现很多抗旱相关基因,例如LEA蛋白、DHN蛋白编码基因,MYB、bZIP、WRKY、NAC和bHLH转录因子等.通过RACE技术克隆其中1个WRKY转录因子的cDNA全长,命名为CkWRKYI,GenBank登录号为JX987095.CkWRKY1编码330个氨基酸的蛋白质,氨基酸序列中有1个“WRKYGQK”的WRKY转录因子家族保守序列,属于第Ⅱ类WRKY转录因子.利用实时荧光定量PCR技术检测发现,CkWRKY1基因在干旱处理后mRNA的表达水平明显上升,预示该转录因子可能与柠条锦鸡儿抗旱的分子机制相关.