杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析
作者单位：刘攀峰,杜红岩,杜兰英,孙志强,LIU Pan-feng,DU Hong-yan,DU Lan-ying,SUN Zhi-qiang(中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州,450003)乌云塔娜,WUYUN Ta-na(国家林业局经济林育种与栽培重点实验室,湖南长沙,410004)
加工时间：2013-12-15
信息来源：林业科学研究
关键词：杜仲;HDR;基因;序列分析;Eucommia ulmoides;HDR gene;sequence analysis
摘 要：以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出HDR基因的cDNA克隆,命名为EuHDR.EuHDR基因cDNA全长1 653 bp,5'端非编码区长82 bp,3'端非编码区长188 bp,编码460个氨基酸,与喜树HDR基因序列相似性最高,达82％；推导EuHDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A33)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A117,A208,A262,A345)；EuHDR蛋白二级结构α-螺旋占35.65％,β-折叠占19.78％,螺环结构占44.57％；EuHDR蛋白三级结构为单体形式,呈不规则的三叶草形状；系统进化分析表明EuHDR蛋白与葡萄HDR蛋白的亲缘关系最为接近.
027-87841330