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结构预测及分子对接方法研究几种水解产物对新阿魏酸酯酶的抑制作用
作者:程凡杰;程凡升;张茂秋;陈婧雨;郑鄢燕;申琳;生吉萍 作者单位:四川大学物理科学与技术学院,成都610041;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京100083;中国人民大学农业与农村发展学院,北京100872 加工时间:2013-11-15 信息来源:《高等学校化学学报》
关键词:阿魏酸酯酶;结构预测;分子对接;抑制作用
摘 要:应用基于生物信息学的蛋白质结构预测方法,探讨了来源于荷斯坦奶牛瘤胃宏基因组文库的一个新型阿魏酸酯酶( FAE-SH1)的结构及可能的催化机制.同时通过对该酶的预测结构与4种模式底物的对接研究发现,实验所测得酶促反应动力参数Vmax与对接的亲和能存在线性关系,底物与酶形成的氢键可能是影响催化效率的关键因素.同时,本研究发现D-木糖、L-阿拉伯糖、D-葡萄糖及阿魏酸能够对FAE-SH1的水解反应产生抑制作用,并对其进行了验证.
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