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烤烟ζ-胡萝卜素脱氢酶基因的克隆与生物信息学分析
作者:刘冬;胡重怡;雷波;蔡刘体 作者单位:长江大学农学院,湖北省荆州市 434023;贵州省烟草科学研究所,贵阳市 550081 加工时间:2013-11-15 信息来源:《烟草科技》
关键词:烤烟;基因;克隆;ζ-胡萝卜素脱氢酶
摘 要:利用同源克隆和电子克隆方法,从烤烟栽培品种韭菜坪2号(Nicotiana tobacum cul.Jiucaiping2)中克隆获得烤烟ζ-胡萝卜素脱氢酶(zeta-carotene desaturase,ZDS)基因的全长cDNA序列(命名为T-zds1),并对其编码蛋白的一级、二级进行了预测.该基因在GenBank中的登录号为JF975566,全长为2312 bp,编码的蛋白含588个氨基酸,蛋白登录号AEG73891.BLASTp搜索结果及进化分析结果表明,烤烟T-zds1基因编码氨基酸序列与番茄、向日葵、胡萝卜ZDS基因编码氨基酸序列的相似性分别为97%,92%,90%.
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