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瓯江彩鲤体色相关基因Sox10的分离与表达分析
作者单位:农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海海洋大学,上海 201306 加工时间:2014-05-15 信息来源:中国水产科学
关键词:瓯江彩鲤;Sox10基因;体色;RT-PCR;基因调控;Cyprinus carpio var. color;Sox10;body color;real-time PCR;gene regulation
摘 要:为探明鱼类体色变异的相关调控因子,采用 RT-PCR 及 RACE 技术获得总长度为2830 bp 的瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var. color) Sox10基因cDNA序列。该基因序列的5′和3′非编码区分别为9 bp和1375 bp,开放阅读框1446 bp,编码481个氨基酸。氨基酸序列的系统发育分析表明,瓯江彩鲤Sox10基因的氨基酸序列与部分物种的相似性在59%~94%。RT-PCR分析表明,该基因在瓯江彩鲤皮肤、肌肉、眼睛和鳔表达量最高,鳃和心表达量次之,肾和肝没有表达。荧光定量PCR分析显示, Sox10基因在体色类型为白色(“粉玉”体色)的表达量显著地高于其他体色(P
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