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斜带石斑鱼 IFN-γ基因的克隆与表达分析
作者单位:黄贝,陈善楠,聂品(中国科学院 水生生物研究所, 淡水生态与生物技术国家重点实验室, 湖北 武汉 430072)黄文树(集美大学 水产学院, 福建 厦门 361021) 加工时间:2013-10-15 信息来源:中国水产科学
关键词:Ⅱ型干扰素;IFN-γ;基因表达;斜带石斑鱼;typeⅡinterferon;IFN-γ;gene expression;Epinephelus coioides
摘 要:IFN-γ在天然免疫和适应性免疫应答中均发挥着重要的作用.由于低等脊椎动物 IFN-γ与哺乳动物 IFN-γ相似性非常低,硬骨鱼类的 IFN-γ近年来才得到鉴定.本研究报道了斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)的 IFN-γ基因,并对其表达进行了分析.斜带石斑鱼 IFN-γ cDNA 全长为867 bp,编码200个氨基酸.其基因组全长为5104 bp,由4个外显子、3个内含子组成.氨基酸序列比对显示斜带石斑鱼 IFN-γ与高等脊椎动物 IFN-γ的序列相似性较低,仅为32.5%~39%,与其他硬骨鱼类的 IFN-γ相似性为38.0%~68.5%.序列分析结果显示,斜带石斑鱼 IFN-γ分子 C末端中存在 IFN-γ的特征序列以及核定位基序.二级结构分析结果显示斜带石斑鱼 IFN-γ序列中包含6个α螺旋结构,其排列与高等脊椎动物的 IFN-γ类似.应用荧光定量 PCR 检测了 IFN-γ基因在 Poly I:C 诱导后的表达变化.发现在肾、脾、鳃、头肾、皮肤和胸腺组织中, Poly I:C 能显著诱导 IFN-γ的表达,在胸腺中上调倍数最高,其次为头肾、脾、肾、皮肤和鳃,而在脑和心脏组织中没有显著变化.据此推测, IFN-γ在斜带石斑鱼抵抗病毒感染的过程中起有十分重要的作用.
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