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牛枝子抗旱候选基因LpDREB的克隆与表达及单核苷酸多态性分析
作者:李静;袁虎威;李伟 作者单位:北京林业大学 林木育种国家工程实验室 林木花卉遗传育种教育部重点实验室 北京 100083 加工时间:2014-05-15 信息来源:《林业科学》
关键词:牛枝子;LpDREB基因;诱导表达;序列分析;单核苷酸多态性
摘 要:牛枝子为胡枝子属中最具耐旱特性的灌木树种,是研究基于单核苷酸多态性(SNP)水平的植物个体间耐旱差异机制的重要材料.以5个种源的天然牛枝子为材料,利用染色体步移技术克隆牛枝子抗旱候选基因LpDREB的全长序列,对LpDREB基因的结构和系统进化进行分析,研究LpDRB基因的组织及诱导表达规律,分析LpDREB基因的SNP分布和类型.研究结果表明:克隆的牛枝子LpDREB基因cDNA片段全长为1 611 bp,具有937 bp的开放阅读框,编码318个氨基酸,包含DREB基因所特有的DREBP/AP2保守区域.LpDREB基因同大豆GmDREB3基因的进化关系最近,但2个基因除保守区域外的其他区域相似性不高.牛枝子LpDREB基因受干旱胁迫诱导表达,在组织器官中的根部表达量最大,其次为叶片,茎中的表达量最少.在天然牛枝子群体中共检测到23个SNP位点,其中启动子及5'端非编码区4个,编码区17个,3'端非编码区2个;23个SNP中,12个属于转换,11个属于颠换;编码区内的17个SNPs位点中,9个属于同义突变,8个为非同义突变,同义突变与非同义突变的比值为1.1.研究结果为基于SNP水平的牛枝子抗旱候选基因的关联分析奠定基础.
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