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基于4300DNA分析系统的茶树SSR发掘方法优化与建立
作者:张洁茹;韦朝领 作者单位:安徽农业大学农业部茶树生物学与茶叶加工重点实验室 加工时间:2014-11-07 信息来源:茶业科学 索取原文[8 页]
关键词:茶树;4300 DNA 分析系统;SSR-PCR
摘 要:简单序列重复(Simple sequence repeats, SSR)在茶树遗传与育种研究中具有重要的作用,基于4300DNA 分析系统的SSR 发掘具有通量高、准确和灵敏等特点,已被用于许多物种的分子标记研究,但在茶树的相关研究中尚未见报道。本研究应用单因素试验和L9(34)正交设计试验对影响茶树SSR-PCR 的主要参数进行优化,建立了适合于4300 DNA 分析系统的茶树SSR-PCR 反应体系:1.0 μL DNA(25 ng·μL-1),0.2 μLM13F-F、0.2 μL R 和0.4 μL IR-M13F,0.8 μL dNTPs(25 mmol·L-1),1.0 μL 10×Buffer(含Mg2+),0.1 μLEx-Taq 聚合酶(5 U·μL-1),无菌水定容至10 μL。所有引物浓度均为1 μmol·L-1。同时,本研究还证明,可以以自行配制的6.5%聚丙烯酰胺凝胶溶液(acry∶bis=29∶1)替代4300 DNA 分析系统指定凝胶溶液,检测SSR 位点。
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