基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较
作者单位:黄平,郑勇奇,张川红,Huang Ping,Zheng Yongqi,Zhang Chuanhong(国家林业局植物新品种分子测定实验室 国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所 北京100091)崔娇鹏,Cui Jiaopeng(北京植物园 北京100093)
加工时间:2013-10-15
信息来源:林业科学
关键词:月季;品种;多倍体;微卫星标记;遗传相似系数;聚类分析
摘 要:以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树.通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性.分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726 ~1.000.共表型相关系数rc介于0.85~0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现.系统树之间的CI.指数范围为0.468 ~1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异.7个遗传相似系数的S统计值介于16.24% ~ 29.90%,Russel and Rao系数最低,Simple Matching等3个系数S值均大于20%.综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是Simple Matching系数.