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“粉玉”体色瓯江彩鲤MHC class ⅡB基因多态性及其与鱼体抗病力的关系
作者:王成辉;赵雪锦;刘至治;李雪松;王宇 作者单位:上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海201306;上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306 加工时间:2014-05-15 信息来源:《中国水产科学》
关键词:"粉玉"体色瓯江彩鲤;主要组织相容性复合体;多态性;抗病力
摘 要:利用1对特异性引物DABF和DABR,分别从30尾感病和13尾抗病“粉玉”体色瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)的cDNA中扩增出长度为624 bp的MHC classⅡB基因片段.对210个有效克隆进行测序,获得84个不同的编码序列,分属13个不同的等位基因,其中Cyca-DAB3*17和Cyca-DAB3 *18为新发现的2个等位基因.核苷酸、氨基酸变异位点总数为267、130,变异率较高( 42.79%、62.50%).MHCⅡB基因片段包括第1-4个外显子,分别编码信号肽、β1和β2结构域及跨膜区.β1结构域的变异明显大于β2结构域,表现为在长度为276 bp的β1结构域中,核苷酸、氨基酸变异位点分别为150个(54.35%)和72个(78.26%);而长度为282bp的β2结构域的核苷酸、氨基酸变异位点较少,分别为105个(37.23%)和54个(57.45%).在p1结构域的24个抗原结合位点(PBR)上,有22个发生了变异.β1结构域的PBR、非抗原结合位点(non-PBR)及β2结构域的非同义碱基替换率(dN)与同义碱基替换率(ds)的比值w分别为1.366、0.992、0.792,表明“粉玉”体色瓯江彩鲤MHC classⅡB基因的β1结构域在进化过程中受到正向选择作用.基因Cyca-DAB3 *09在抗病群体中出现的频率(7.81%)显著高于感病群体(1.37%,P<0.05),新等位基因Cyc-DAB3*18(频率为3.13%)只出现在抗病群体中,基因Cyca-DAB1 *08、Cyca-DAB3 *08和Cyca-DAB3*17为感病群体所特有.研究结果为抗病“粉玉”体色瓯江彩鲤的选育奠定了基础.
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