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南海金线鱼属Nemipterus鱼类CO Ⅰ和Cyt b基因片段的比较分析
作者:黄梓荣;李永振;陈国宝;董丽娜 作者单位:中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300;中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 加工时间:2014-05-15 信息来源:《中国水产科学》
关键词:金线鱼属;线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因;细胞色素b基因;序列差异;南海
摘 要:基于线粒体细胞色素b (Cyt b)和细胞色素氧化酶Ⅰ基因(CO Ⅰ)片段,运用PCR直接测序法,对采自南海的金线鱼(Nemipterus virgatus)、日本金线鱼(N.japonicus)、深水金线鱼(N.bathybius)、红棘金线鱼(N.nemurus)和苏门答腊金线鱼(N.mesoprion)及GenBank中的六齿金线鱼(N.hexodon)、裴氏金线鱼(N.peronii)及红金线鱼(N.furcosus)的序列进行了分析,并比较分析了它们间的序列差异.Cyt b基因序列片段(425 bp)和CO Ⅰ基因序列片段(507 bp)的分析均显示日本金线鱼和红棘金线鱼之间序列差异和遗传距离均最小,CO Ⅰ基因片段中为分别0.25%和0.003,Cytb基因片段中为0和0,两者亲缘关系非常近;几种金线鱼之间尚未达到属的水平,裴氏金线鱼仍属于金线鱼属;两目的片段的NJ系统树均显示,日本金线鱼和红棘金线鱼混杂在一起聚为一支,而日本金线鱼和苏门答腊金线鱼属于不同的发育分支;红棘金线鱼和日本金线鱼是最新分化种,金线鱼则是最早分化种;几种金线鱼类的分化时间大约在中更新世时期.比较属间的系统发育关系,旨在为金线鱼属鱼类分类提供依据,进而对鱼类资源的评估与保护措施提供基础参考.
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