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鲤多拷贝基因Apo-14kDa和ApoE的系统学分析和其在胚胎发育中的功能探索
作者:孙金生;万玉美;徐鹏;孙效文;汪金兔;崔润滋 作者单位:天津师范大学生命科学学院,天津300387;中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京100141;中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京100141;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心,北京100141;天津师范大学生命科学学院,天津300387 加工时间:2014-05-15 信息来源:《中国水产科学》
关键词:鲤;载脂蛋白;Apo-14kDa;ApoE;分子系统学;胚胎发育;基因功能
摘 要:本研究首次从鲤(Cyprinus carpio)中得到2种形式的14 kD载脂蛋白(Apo- 14kD)和4种形式的载脂蛋白E(ApoE),分别为Apo- 14kDa-a和Apo- 14kDa-b(同源性为79%)、ApoE-a1和ApoE-a2(同源性为91%)以及ApoE-bl和ApoE-b2(同源性为90%).系统学分析表明,Apo-14kDa-a与多数硬骨鱼的Apo - 14kDa同源性高于与Apo- 14kDa-b的同源性,而Apo-14kDa-b与草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的Apo- 14kDa同源性较高,提示二者在鲤科鱼类中的分化时间较早;ApoE-a和ApoE-b的分化时间也应该处于鲤科鱼类分化的早期阶段,随后进一步分化出4个同源基因.半定量RT-PCR结果显示Apo-14kDa-a基因在肝、头肾中大量表达,肠中微弱表达,其他组织无表达,Apo-14kDa-b基因只在肝表达;ApoE-al基因和ApoE-a2基因只在肠表达;而ApoE-b1基因和ApoE-b2基因均在脑、皮肤、鳃、肝、精巢、肠、心脏、肌肉、体肾、头肾中表达,但在脾和卵巢发生表达分化.进一步的qRT-PCR检测发现6个基因在不同胚胎发育时期的表达模式也有较大不同,且在不同时期的表达均存在阶段差异性.另外,qRT-PCR分析证实Apo-14kDa基因和ApoE基因均有可能在鲤胚胎发育过程中发挥着重要且显著不同的作用.
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