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普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析
作者单位:林萍,姚小华,曹永庆,龙伟,王开良,LIN Ping,YAO Xiao-hua,CAO Yong-qing,LONG Wei,WANG Kai-liang(中国林业科学研究院亚热带林业研究所,浙江富阳,311400)滕建华,TENG Jian-hua(浙江省金华市东方红林场,浙江金华,321025) 加工时间:2013-11-15 信息来源:林业科学研究
关键词:普通油茶;泛素结合酶;Solexa测序;生物信息学;Camellia oleifera;ubiquitin-conjugating enzyme (E2);Solexa sequencing;bioinformatics
摘 要:泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用.采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8~122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75~122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点.UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员.
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