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电子细胞模型Analog-Cell中前体mRNA剪接过程的模拟与研究
作者:欧阳丹彤;王珏;韩霄松;卢欣华 作者单位:吉林大学计算机科学与技术学院,吉林长春 130012;吉林大学符号计算与知识工程教育部重点实验室,吉林长春 130012 加工时间:2014-05-15 信息来源:《软件学报》
关键词:电子细胞;Analog-Cell;选择性剪接;前体mRNA的剪接
摘 要:真核细胞前体mRNA的剪接加工包含内含子剪切和外显子拼接两个过程,是真核细胞基因表达过程中的一个重要环节.针对这一环节,提出了一种模拟真核细胞前体mRNA内含子剪切及其选择性剪接的算法,并在自主研发的电子细胞模型Analog-Cell中实现了该算法,且获得了符合生物学原理的模拟结果.模拟结果表明,该算法可使剪接体高效、准确地模拟内含子的剪接过程,并形成套索结构,同时有选择地将外显子片段拼接起来,最终形成成熟的mRNA.
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