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落叶松体胚发育中12个针叶树特异microRNAs表达分析
作者:张俊红;吴涛;齐力旺;张守攻;韩素英 作者单位:中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,北京 100091 加工时间:2014-03-15 信息来源:《林业科学研究》
关键词:日本落叶松;体细胞胚胎;microRNA;针叶树;表达分析
摘 要:以落叶松体细胞胚胎发育8个阶段的材料构建小RNA文库,进行了Solexa测序、miRNA鉴定、靶基因预测、qRT-PCR定量分析等研究.结果表明:发现的87个miRNAs中,29个为针叶树特异的,来自12个家族,分别为miR946、miP947、miR950、miR951、miR1311、miR1312、miR1313、miR1314、miR1316、miR3701、miR3702和miR3704,其中25个长度为22nt,且在小RNA文库中的最低拷贝数为18(miR1311),最高拷贝数为33 009(miR950).发现12个miRNA家族的34个靶基因可能参与生长发育、抗病、AGO反馈调节等多方面遗传调控;qRT-PCR分析表明:72%miRNAs表达次高峰在后期单胚或早期子叶胚,在中期子叶胚最低,最高峰在后期子叶胚,分别与子叶形成、胚胎后熟、胚胎休眠的生理活动相吻合,而miRNA前体的表达模式不同于miRNA,前体变化幅度小于成熟体.
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