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Actinoplanes sp.N902-109全基因组序列测定及分析
作者:黄鹤;芦现杰;胡海峰; 加工时间:2015-05-10 信息来源:中国抗生素杂志
关键词:Actinoplanes sp.N902-109;基因组测序;雷帕霉素;生物合成基因簇
摘 要:Actinoplanes sp.N902-109是继吸水链霉菌ATCC292953后分离的第二株能够产生雷帕霉素的放线菌。采用Roche 454GS FLX测序技术和Sanger法PCR测序技术,我们首次完成了Actinoplanes sp.N902-109全基因组序列测定。Actinoplanes sp.N902-109基因组为环状,长度为9228054bp,GC含量71.3%,编码8212个蛋白,其中5460个编码蛋白被注释有明确的生物学功能。应用Anti SMASH和NRPS predictor软件预测基因组中存在22个次级代谢生物合成基因簇,包含首次鉴定的完整的游动放线菌来源雷帕霉素生...
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