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应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱
作者:乔慧;傅洪拓;吴滟;龚永生;蒋速飞;熊贻伟 作者单位:南京农业大学渔业学院,江苏无锡214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,淡水渔业和种质资源利用重点实验室,江苏无锡214081;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,淡水渔业和种质资源利用重点实验室,江苏无锡214081 加工时间:2014-05-15 信息来源:《中国水产科学》
关键词:青虾;日本沼虾;SSR;SRAP;遗传连锁图谱
摘 要:采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾(Macrobrachium nipponense)遗传连锁图谱.共有175个标记(含27个SSR、148个SRAP标记)分布在53个连锁群上.每个连锁群含2~8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个;连锁群长度在6.7~91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM.青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83%.本研究构建了青虾遗传连锁图谱,该图谱也是淡水虾蟹类第一张遗传连锁图谱,可为青虾QTL定位、基因克隆、遗传选育等提供指导,并为进一步构建高密度的青虾遗传连锁图谱奠定了基础.
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