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茶树CsH1基因结构及其内含子信息分析
作者:房婉萍;张玥;阮光兴;陈暄;王玉花;庄静;黎星辉 作者单位:南京农业大学茶叶科学研究所,江苏南京210095 加工时间:2014-02-15 信息来源:《南京农业大学学报》
关键词:茶树;CsHl基因;外显子;内含子;信息分析
摘 要:利用cDNA-AFLP方法对低温胁迫下茶树基因表达差异进行了分析,获得1个低温特异表达的cDNA片段.为了获取该片段所代表基因的结构信息,在成功克隆其基因全长cDNA序列(GenBank登录号:EU716314)的基础上,设计引物,从茶树品种‘龙井43’的叶片中克隆获得了该基因全长DNA序列,命名为茶树CsH1基因(JF836005).基因结构分析表明:CsH1基因包含2个外昆子和1个内含子,外显子和内含子的剪接符合GT-AG原则,其中2个外显子的碱基序列长度分别为236 bp和608bp,内含子为388bp.经序列分析发现该内含子具有启动子及激素调控元件,可能对CsH1基因的特异性表达有调控作用.茶树CsH1基因的结构及其内含子信息为茶树低温特异基因的表达和抗寒途径分子调控提供了序列信息.
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