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烟草抗多种病毒应答基因的筛选
作者单位:翟妞,许亚龙,罗朝鹏,杨军,周会娜,ZHAI Niu,XU Yalong,LUO Zhaopeng,YANG Jun,ZHOU Huina(中国烟草总公司郑州烟草研究院,郑州高新技术产业开发区枫杨街2号,450001)张俊祺,ZHANG Junqi(云南省烟草公司普洱市公司,云南省普洱市澜沧县东朗路84号,665600) 加工时间:2014-01-15 信息来源:烟草科技
关键词:黄瓜花叶病毒;烟草花叶病毒;马铃薯Y病毒;qPCR;转录组测序;Cucumber mosaic virus;Tobacco mosaic virus;Potato virus Y;qPCR;Transcriptome sequencing
摘 要:为了筛选烟草抗多种病毒的内源应答基因,以普通烟草和对应的转基因烟草(转有发卡结构)为材料,同时接种3种病毒,黄瓜花叶病毒(CMV)、烟草普通花叶病毒(TMV)和马铃薯Y病毒(PVY).在接种病毒后6h和3周(转发卡结构烟草具有明显的抗病毒特性时)分别取样,进行转录组测序寻找抗多种病毒应答基因.进一步进行生物信息学分析得到40个差异基因,通过实时荧光定量PCR(qPCR)验证,获得了明显差异基因9个(酶类和功能蛋白类).
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