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4种有机磷农药DNA适体的筛选及结构分析
作者单位:王丽(南京农业大学食品科技学院,江苏南京210095;安徽科技学院食品药品学院,安徽凤阳233100)刘贤金,张存政,刘媛(江苏省农业科学院食品质量安全与检测研究所/农业部食品质量安全监控重点开放实验室,江苏南京,210014)屠康(南京农业大学食品科技学院,江苏南京,210095) 加工时间:2014-05-15 信息来源:南京农业大学学报
关键词:有机磷农药;DNA适体;指数富集的配体系统进化(SELEX);筛选;结构分析;organophosphorus pesticide;DNA aptamer;systematic evolution of ligands by exponential enrichment(SELEX);selection;structure analysis
摘 要:利用SELEX技术从一个固定的随机ssDNA库中同时筛选甲拌磷、丙溴磷、水胺硫磷、氧化乐果4种有机磷农药的DNA适体.随着筛选轮数的增加,4种有机磷农药从固定的随机库中洗脱的ssDNA逐渐富集,经过12轮的筛选,筛选效率达到40.8%.对第12轮洗脱的ssDNA进行克隆、测序,挑选的15个阳性克隆均测序成功,由于部分克隆具有完全一致的序列,最终筛选到5条ssDNA序列.一级结构序列分析表明5条ssDNA具有一定的同源性,二级结构预测表明5条ssDNA的二级结构主要以茎环结构为主,表明茎环结构可能是适体结合4种有机磷农药的基础.
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