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连接环、末端碱基及一价阳离子对G-四链体结构的影响
作者: 常天俊;李刚;赵可旭;班琳;卞文秀;邴涛;上官棣华 作者单位:河南理工大学资源环境学院;中国科学院化学研究所,北京分子科学国家实验室,活体分析化学院重点实验室 加工时间:2014-12-26 信息来源:高等学校化学学报 索取原文[7 页]
关键词:G-四链体;拓扑结构;DNA;自组装;多聚体
摘 要:研究了G-四链体中的连接环(Loop)、末端碱基和一价阳离子对其结构的影响,发现在K+溶液中Loop短的序列易形成平行结构,无末端碱基时容易形成多聚体,而反平行或混合平行/反平行的G-四链体则难以形成多聚体;一价阳离子K+,NH+4和Na+促进形成平行结构及多聚体的能力依次减弱。在平行G-四链体的3’或5’端增加非G碱基,或改变阳离子使其形成非平行结构,均可抑制多聚体的形成。Loop长度影响G-四链体的热稳定性,Loop短的序列可形成很稳定的分子内结构;无末端碱基的G-四链体多聚体的稳定性低于单个G-四链体,且多聚体随着温度升高而变小。结果表明,在K+溶液中,无末端碱基的平行G-四链体序列首先形成分子内结构,然后通过π-π堆积形成多聚体;末端碱基及反平行或混合平行/反平行G-四链体中的Loop可阻碍末端堆积作用,抑制多聚体的形成。本研究为G-四链体的结构与功能研究提供了有用信息。
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