应用微阵列芯片检测与2型糖尿病相关的单核苷酸多态性
作者单位:陈琰,CHEN Yan(吉林大学中日联谊医院中心研究室,长春130033;吉林大学第二医院内分泌科,长春130042)刘桂锋,LIU Gui-Feng(吉林大学中日联谊医院,放射线科,长春130033)刘霞,王振新,LIU Xia,WANG Zhen-Xin(中国科学院长春应用化学研究所,电分析国家重点实验室,长春130022)张桂珍,ZHANG Gui-Zhen(吉林大学中日联谊医院中心研究室,长春,130033)
加工时间:2014-05-15
信息来源:高等学校化学学报
关键词:寡核苷酸微阵列;2型糖尿病;等位基因频率;核苷酸探针
摘 要:基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针.使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为基底,以氨基修饰的寡核苷酸为固定探针构建3D寡核苷酸微阵列芯片.采用荧光化合物Cy5修饰的寡核苷酸为检测探针获得荧光信号.以2型糖尿病易感基因TCF7L2的rs7903146位点为研究对象,通过对含有16种(8对)寡核苷酸的寡核苷酸文库的筛选,获得了1对能用于2型糖尿病检测的寡核苷酸探针.通过单核苷酸多态性和等位基因分析证明,该寡核苷酸探针对靶标寡核苷酸检测具有高特异性,并能准确检测低至2%的等位基因频率.