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新研究或揭示新冠传染力为何强 受体亲和力十多倍于SARS
科学界针对新冠病毒的研究又有新进展。美国得克萨斯大学奥斯汀分校的杰森·麦克莱伦(Jason S Mclellan)研究团队日前在预印本平台bioRxiv上发表的论文显示,该团队利用冷冻电镜技术分析了新冠病毒(SARS-CoV-2)表面刺突糖蛋白(S蛋白)的近原子结构,引起学界关注。研究团队初步发现,新冠病毒与人类血管紧张素转化酶2(ACE2)的亲和力为SARS病毒的10-20倍。
上述研究的通讯作者麦克莱伦是美国国立卫生研究院过敏与传染病研究所(NIAID)下属的疫苗研究中心的成员。生物学预印本平台bioRxiv创立于2013年,由冷泉港实验室运营,发表在bioRxiv上的论文尚未经过正式的同行评议。
S蛋白是新冠病毒感染机体的关键组分,也是研制新冠肺炎疫苗和抗体抑制剂的关键靶点。研究团队确定了预融合构象中的新冠病毒S蛋白三聚体的冷冻电镜结构,其分辨率为3.5埃(1埃=0.1纳米)。研究发现,新冠病毒利用高度糖基化的同源三聚体S蛋白进入宿主细胞。在这一过程中,包裹病毒的S1亚基结合到宿主细胞受体上,触发了三聚体的不稳定性,造成S1亚基脱落,并让S2亚基最终可以在融合后形成高度稳定的结构。
通过对该结构进一步分析,研究发现新冠病毒S1亚基受体结合域的移动特点与SARS冠状病毒(SARS-CoV)以及中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)非常相似,但新冠病毒中的受体结合域更靠近三聚体的中央部位。新冠病毒的S蛋白3个受体结合域中,有一个会向上螺旋突出让S蛋白形成一种空间构象,能够轻易与宿主受体ACE2结合。
受体结合域(receptor binding domain, RBD)是病毒表面蛋白用来与受体结合的部分。病毒通过它去和人体内细胞上的受体(receptor)结合,比如,SARS-CoV的RBD定位在刺突蛋白的第319到510位氨基酸(AA319-510)。
研究进一步通过对病毒表面等离子共振(SPR)动力学的量化研究,发现新冠病毒的S蛋白与细胞ACE2的亲和力是SARS-CoV的10-20倍。研究提示,新冠病毒对于人类 ACE2 受体的高亲和力,可能有助于它在人与人之间的传播变得更加容易,但还需要进一步的研究来佐证这种可能性。
此外,由于新冠病毒与SARS-CoV的结构同源性,研究团队还测试了三种曾研发用于结合SARS-CoV突刺蛋白的单克隆抗体(S230、m396和80R,下称单抗)。结果显示,尽管这两种病毒的受体结合域结构高度相似,SARS-CoV的单抗对于新冠病毒并没有发生明显的结合,对新冠病毒不具有交叉反应。
荷兰莱顿大学医学院病毒学家Mariet Feltkamp在其个人社交平台上强调了上述研究中的两大发现:一个是SARS-CoV-2的受体结合域与人类ACE2受体的亲和力高于SARS-CoV;另一个是以SARS-CoV 受体结合域为导向的单克隆抗体与SARS-CoV-2没有明显的结合,表明抗体交叉反应性有限。
加拿大麦吉尔大学结构生物学助理教授Natalie Zeytuni则表示,这进一步证实了冷冻电镜技术在及时开发药物方面的必要性。