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式根岛海绵宏基因组文库的抗菌吲哚三聚体
作者单位:生物流变科学与技术教育部重点实验室,重庆大学生物工程学院,重庆400030 加工时间:2014-03-15 信息来源:高等学校化学学报
关键词:海绵;宏基因组文库;双层琼脂法;吲哚三聚体;Marine sponge;Metagenomic library;Two-layer top agar;Indole trimer
摘 要:构建了式根岛海绵的宏基因组文库,对其进行双层琼脂抗菌活性功能筛选,得到1株抗菌活性克隆pDC111.以抗菌活性为指导,对pDC111的化学成分进行分析和分离,得到化合物1,并通过1D NMR(1 H NMR和13C NMR)及2D NMR(1H-1H COSY,HMQC和HMBC)结合HR-TOFMS数据,确定其结构为吲哚三聚体.抗菌活性实验结果表明,化合物1在10 μg/paper(id=6 mm)时,对蜡状芽孢杆菌的抑菌圈达到12mm.本文利用功能宏基因组方法,从蕴藏大量不可培养微生物的海绵中寻找到活性物,并具有通过分子生物学技术获得其功能基因的潜能.
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