改革开放以来，我国产业结构发生巨大转变，大量第一产业的劳动力向第二和第三产业转移，农村土地一度陷入无人耕种的情况。为保障粮食供给和土地资源的合理利用，国家实行农村土地流转制度，优化农用土地资源的配置，促进农村农业可持续发展。但在土地流转制度的适用过程中，农地的生态环境问题并没有得到政府和学界的重视，立法和改革的重点多放在土地流转制度及其运行效率、农户与土地经营主体的经济利益等方面。虽然农地流转制度的实施提高了农户与土地经营者的经济收入，但同时也对农地生态环境造成了威胁，埋下了破坏生态环境的隐患。因此，农地流转中的生态环境保护问题必须受到重视，应当制定相应的规章制度对土地使用权受让人对农地资源的开发利用行为，以达到农地资源的可持续发展的目的。