在气候变化和人类活动双重作用下，新疆天然尾闾湖泊急剧萎缩，湖泊生态系统服务功能大幅度降低乃至丧失。本文梳理了新疆尾闾湖泊存在的问题，主要表现为：湖泊数量和面积显著减少，蓄水能力下降；湖泊水质普遍下降，矿化度总体上升；湖泊生态系统退化，生物多样性下降。在分析问题的基础上，本研究提出了尾闾湖泊修复的指导思想：统筹流域山水林田湖草沙冰，综合治理，因湖制宜，重点引领，分步实施；提出了恢复有“度”、修复有“量”，生活水宽，工业水紧，生态水保，农业水节等策略；针对典型湖泊生态修复工作总结出了调整产业结构、降低农业用水比例，流域内外生态补水，水资源优化配置，土地沙化防护，湖泊生态环境保护带建设，水质污染防治，河道治理，生物多样性保护等多项生态修复措施。本文可为开展干旱区尾闾湖泊的生态修复，加强流域环境管理，制定水资源保护及水质管理规划，制定生态保护策略及保护目标提供决策依据和实践指导。