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华大助力西北工大为葱属植物育种应用提供新线索 洋葱的特殊气味咋来的?
近日,西北工业大学联合华大在国际期刊《自然·遗传学》(Nature Genetics)发表洋葱发育机制最新研究成果。该研究基于华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq,首次绘制了洋葱鳞茎组织不同发育阶段的时空图谱,揭示了葱属植物重要性状形成和演化的分子机制。该研究为推动葱属作物进入分子育种新阶段奠定了重要基础。
大蒜、洋葱、韭菜等葱属植物,常在人们的餐桌中出现。然而,由于长期缺乏高品质的参考基因组,葱属植物的生物学研究与作物育种进程严重受到阻碍,其基因组进化及特殊气味的形成问题也一直困扰著学界。
研究团队选择了洋葱、大葱、大蒜3种最为常见的葱属植物,以及近亲品种百子莲作为外群,开展染色体级别的基因组解析工作,完成了四个物种的高品质基因组组装。通过进一步分析,研究发现了葱属植物复杂的基因组加倍历史,其很可能对葱属的巨大基因组和极高的物种多样性有重要贡献。此外,研究揭示了基因的拷贝增加和序列变化共同导致了葱属特有风味的形成。
“本项研究凸显了华大时空组学Stereo-seq技术在植物生物学研究中的巨大潜力。"华大生命科学研究院院长徐讯表示,“Stereo-seq技术兼具纳米级解析度和厘米级全景视场的优势,能够帮助研究人员从空间和时间两个维度对洋葱球茎膨大过程开展研究,获取更加丰富和重要的细胞形态与空间位置资讯,在研究中发挥了关键的作用。"
据悉,本项研究作为地球生物基因组计画(EBP)的子项目之一,展示了利用基因组大资料对生物多样性资源进行遗传解析和研究利用的重要价值和意义。