用定量蛋白银染色法，对太湖浮游纤毛虫进行定性和定量研究，同时用多元统计方法分析生物和非生物因子对其影响。在全湖设置32 个点位进行季度采样，共检出117 种纤毛虫，隶属于3 纲、15 目、78 属，其中95 种鉴定到种的水平。纤毛虫平均丰度27170个/L( 1 500 — 139 150 个/L) ，平均生物量600．6 μg /L( 16．7 — 8736．0 μg /L) ，以寡毛目、前口目、盾纤目、缘毛目和钩刺目为主。优势种包括: 浮游藤壶虫、趣尾毛虫、顶口睥睨虫、银灰膜袋虫、水生钟虫复合种、钟形钟虫、杯铃壳虫、双叉弹跳虫、大弹跳虫、短列裂隙虫、小裂隙虫、圆筒状似铃壳虫。纤毛虫群落结构空间异质性较高，丰度上呈现从南向北、从敞水区向沿岸河口区逐渐增加的趋势; 北部湖区以小个体的寡毛目、盾纤目、前口目为主，而南部主要以大个体的寡毛目为主; 从功能摄食类上看，北部各点以食菌种类为主，而南部以食藻种类居多。该类群季节变化明显，于夏季出现丰度峰值，生物量是冬、夏季显著高于春、秋季。通过CCA 多元分析发现，太湖纤毛虫群落结构差异主要与水体营养水平、桡足类数量和pH 值等有关，且在不同季节由不同的环境因子调控。